Alien Frontiers: Facciones añade una serie de elementos al juego base de Alien Frontiers:

Fichas de naves y colonias para un quinto jugador.
Facciones (de ahí su nombre), en las que cada facción proporciona a su propietario una habilidad especial y nuevas instalaciones orbitales bajo su control.
Agendas, que son objetivos ocultos que permiten a un jugador ganar puntos de bonificación al final de la partida o cuando la agenda se revela en el juego.
Nuevas cartas de tecnología alienígena, como el Túnel Lunar, que permitirá a su propietario pagar un combustible para recibir un mineral extra al usar la Mina Lunar. El poder de descarte de esta carta enviará todas las naves atracadas en la Mina Lunar a la Bahía de Mantenimiento, lo que puede ser útil cuando la Mina esté atascada con naves de alto valor.