En el juego de construcción de mazos Naruto Shippuden, juegas como Naruto o uno de sus camaradas y te enfrentas a criminales de rango S como Orochimaru y miembros de la Akatsuki mientras exploras tierras lejanas en tu camino para convertirte en el mejor ninja de la historia. Aunque empiezas con las habilidades básicas, ganarás aliados, obtendrás equipo, construirás chakra y dominarás nuevas y poderosas técnicas, con el objetivo de derrotar a todos los archienemigos que puedas.

Naruto Shippuden Deck-Building Game utiliza el motor de juego de construcción de mazos "Cerebus" de Cryptozoic, en el que los jugadores utilizan el Poder como moneda para adquirir o derrotar las cartas disponibles, pero también introduce el Chakra, una nueva fuente de energía para tu personaje y muchas de las cartas que juegas. ¿Centrarás tu construcción de mazos en maximizar tus puntos de Chakra? ¿Probarás las nuevas innovaciones del juego, como los ataques positivos y las cartas que te dan una bonificación nada más comprarlas?